Las causas de infertilidad pueden ser mecánicas, hormonales, por lesiones en los órganos o mal funcionamiento de éstos.

Masculinas: Los tres problemas de infertilidad más frecuentes en el hombre son la ozoospermia (ausencia total del espermatozoides en el semen), oligospermia (poca cantidad de espermatozoides) y teratospermia (elevada producción de espermatozoides inmaduros o con formas anormales).

Femeninas: Pueden ser mecánicas u hormonales. Entre las primeras, se destacan las lesiones en las trompas, responsables de la tercera parte de las infertilidades femeninas. Otra causa frecuente es la endometriosis que produce lo que se conoce como quistes de chocolate, que pueden obstruir las trompas o afectar el ovario(el 25% de las mujeres estériles tienen algún grado de endometriosis).